MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC plasmid pRKC30SC1

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015213	A	6	6	38	43	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015213	TCA	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015213	ATA	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015213	CCT	2	6	159	164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015213	TTG	2	6	215	220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015213	TTTGA	2	10	230	239	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015213	T	7	7	306	312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015213	ATTTT	2	10	321	330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015213	A	6	6	396	401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015213	T	6	6	526	531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015213	ACT	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015213	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015213	TGAT	2	8	748	755	25 %	50 %	25 %	0 %	325955699
14	NC_015213	GAT	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955699
15	NC_015213	CTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955699
16	NC_015213	TTAA	2	8	1041	1048	50 %	50 %	0 %	0 %	325955699
17	NC_015213	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955699
18	NC_015213	TACA	2	8	1094	1101	50 %	25 %	0 %	25 %	325955699
19	NC_015213	GAAT	2	8	1120	1127	50 %	25 %	25 %	0 %	325955699
20	NC_015213	CAA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955699
21	NC_015213	ATCC	2	8	1185	1192	25 %	25 %	0 %	50 %	325955699
22	NC_015213	AAC	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955699
23	NC_015213	A	6	6	1212	1217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015213	GTAGCA	2	12	1228	1239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015213	T	7	7	1243	1249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015213	TA	3	6	1265	1270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015213	ATA	2	6	1278	1283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015213	ATT	2	6	1345	1350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955700
29	NC_015213	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955700
30	NC_015213	ATA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955700
31	NC_015213	TGA	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955700
32	NC_015213	TA	3	6	1513	1518	50 %	50 %	0 %	0 %	325955700
33	NC_015213	TTA	2	6	1564	1569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955700
34	NC_015213	CTT	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955700
35	NC_015213	CAA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955700
36	NC_015213	AGAT	2	8	1713	1720	50 %	25 %	25 %	0 %	325955700
37	NC_015213	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	325955700
38	NC_015213	AAT	2	6	1754	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955700
39	NC_015213	TG	3	6	1761	1766	0 %	50 %	50 %	0 %	325955700
40	NC_015213	CAA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955700
41	NC_015213	TGTT	2	8	1806	1813	0 %	75 %	25 %	0 %	325955700
42	NC_015213	TCG	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955700
43	NC_015213	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955700
44	NC_015213	TAAA	2	8	2112	2119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015213	TTTG	2	8	2136	2143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015213	TATT	2	8	2205	2212	25 %	75 %	0 %	0 %	325955701
47	NC_015213	CTT	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015213	TAT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015213	AC	3	6	2381	2386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015213	CAC	2	6	2555	2560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015213	T	6	6	2561	2566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015213	TAA	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015213	AG	3	6	2610	2615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015213	AAG	2	6	2723	2728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015213	TCG	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015213	TAAAA	2	10	2873	2882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015213	GTT	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015213	TAT	2	6	2924	2929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015213	CGA	2	6	2955	2960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015213	TAA	2	6	2965	2970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015213	A	6	6	2979	2984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015213	T	6	6	3081	3086	0 %	100 %	0 %	0 %	325955702
63	NC_015213	ATT	3	9	3268	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955702
64	NC_015213	ATCT	2	8	3279	3286	25 %	50 %	0 %	25 %	325955702
65	NC_015213	T	7	7	3370	3376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015213	GAA	2	6	3423	3428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955703
67	NC_015213	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955703
68	NC_015213	ACTC	2	8	3453	3460	25 %	25 %	0 %	50 %	325955703
69	NC_015213	GAATG	2	10	3675	3684	40 %	20 %	40 %	0 %	325955703
70	NC_015213	GTCC	2	8	3906	3913	0 %	25 %	25 %	50 %	325955703
71	NC_015213	ACT	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955703
72	NC_015213	TAA	2	6	4001	4006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955703
73	NC_015213	TTG	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955703
74	NC_015213	ATG	2	6	4145	4150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955703
75	NC_015213	A	6	6	4210	4215	100 %	0 %	0 %	0 %	325955703
76	NC_015213	AGT	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955703
77	NC_015213	T	7	7	4372	4378	0 %	100 %	0 %	0 %	325955703
78	NC_015213	CGCC	2	8	4388	4395	0 %	0 %	25 %	75 %	325955703
79	NC_015213	TTG	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955703
80	NC_015213	T	7	7	4477	4483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015213	TAAA	2	8	4486	4493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015213	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015213	AC	3	6	4576	4581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015213	TTC	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015213	TC	3	6	4672	4677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015213	CAG	2	6	4698	4703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015213	T	8	8	4762	4769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015213	A	7	7	4786	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015213	CTG	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015213	TTC	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015213	GCA	2	6	4919	4924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015213	CAAA	2	8	4930	4937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015213	AGATAG	2	12	4965	4976	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015213	ATC	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015213	A	7	7	5058	5064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015213	CAAA	2	8	5076	5083	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015213	TTG	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015213	T	6	6	5168	5173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015213	TAAAAA	2	12	5190	5201	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015213	ACA	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015213	ACAG	2	8	5250	5257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015213	ACA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015213	A	6	6	5296	5301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015213	AAATA	2	10	5313	5322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015213	ACTA	2	8	5329	5336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015213	A	6	6	5386	5391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015213	A	6	6	5400	5405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015213	T	7	7	5410	5416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015213	T	6	6	5461	5466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015213	A	6	6	5481	5486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015213	ATT	2	6	5502	5507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015213	AAT	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015213	A	7	7	5568	5574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015213	TATG	2	8	5650	5657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015213	TAATT	2	10	5666	5675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015213	AT	3	6	5743	5748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015213	TAAA	2	8	5788	5795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015213	A	6	6	5793	5798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015213	T	6	6	5823	5828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015213	ATTT	2	8	5829	5836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015213	T	6	6	5834	5839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015213	T	6	6	5899	5904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015213	ATAAAA	2	12	6008	6019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015213	TCC	2	6	6020	6025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015213	T	6	6	6028	6033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015213	TTG	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015213	CTT	2	6	6162	6167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015213	TTC	2	6	6199	6204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015213	T	6	6	6208	6213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015213	TCT	2	6	6317	6322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015213	TAT	4	12	6363	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015213	ATT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015213	TAA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015213	TA	4	8	6462	6469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015213	TA	3	6	6475	6480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015213	TTTA	2	8	6487	6494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015213	T	6	6	6589	6594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015213	T	7	7	6668	6674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015213	CTT	2	6	6698	6703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015213	TGT	2	6	6784	6789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015213	T	6	6	6835	6840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015213	ATTTTT	2	12	6841	6852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015213	ATA	2	6	6946	6951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015213	CAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015213	TAA	2	6	7100	7105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015213	CGT	3	9	7119	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.